Khai thác hợp nhất đề cập đến hành động khai thác hai hoặc nhiều loại tiền điện tử cùng một lúc mà không làm giảm hiệu suất khai thác tổng thể. Về cơ bản, người khai thác có thể sử dụng sức mạnh tính toán của mình để khai thác đồng thời các khối trên nhiều chuỗi thông qua việc sử dụng cái được gọi là Bằng chứng công việc phụ trợ (AuxPoW).

Ý tưởng đằng sau AuxPoW là công việc được thực hiện trên một chuỗi khối có thể được coi là công việc hợp lệ trên một chuỗi khác. Chuỗi khối cung cấp bằng chứng công việc được gọi là chuỗi khối gốc, trong khi chuỗi khối chấp nhận nó hợp lệ là chuỗi khối phụ.

Để thực hiện khai thác hợp nhất, tất cả các loại tiền điện tử liên quan phải được sử dụng cùng một thuật toán. Ví dụ: Bitcoin sử dụng SHA-256, nghĩa là hầu như mọi đồng tiền khác sử dụng SHA-256 đều có thể được khai thác cùng với Bitcoin - miễn là việc triển khai kỹ thuật được thực hiện đúng cách.

Đáng chú ý , chuỗi khối gốc hầu như không bị ảnh hưởng vì nó không phải trải qua bất kỳ loại sửa đổi kỹ thuật nào. Mặt khác, chuỗi khối phụ trợ cần được lập trình để tiếp nhận và chấp nhận công việc của chuỗi gốc một cách hiệu quả. Thông thường, việc thêm hoặc xóa hỗ trợ cho hoạt động khai thác hợp nhất đòi hỏi phải có phân nhánh cứng.

Về lý thuyết, khai thác hợp nhất có thể là một phương pháp thú vị để một chuỗi khối nhỏ (hàm băm thấp) tăng cường tính bảo mật của chúng bằng cách tận dụng sức mạnh băm của Bitcoin hoặc một chuỗi khác lớn hơn. Điều này có khả năng làm giảm khả năng xảy ra 51% tấn công, miễn là có đủ số lượng thợ mỏ đồng ý áp dụng hoạt động khai thác hợp nhất.

Tuy nhiên, nhiều nhà phát triển không đồng ý với ý tưởng như vậy và cho rằng hoạt động khai thác hợp nhất mang lại cảm giác an toàn giả tạo. Chủ yếu là do nhóm khai thác tương đối lớn không chiếm ưu thế đặc biệt trên Bitcoin có thể dễ dàng đạt được công suất băm 51% trên chuỗi nhỏ hơn. Một lập luận phản bác lại điều này là nếu phần thưởng hoặc ưu đãi đủ tốt để khai thác chuỗi phụ trợ này, nó sẽ thu hút nhiều người khai thác hơn, do đó làm giảm tính tập trung và tăng cường bảo mật. 

Ngoài điều đó ra , một số người nói rằng việc khai thác hợp nhất làm giảm tính bảo mật vì các tổn thất kinh tế được loại bỏ khỏi quy trình. Chẳng hạn, những người khai thác Bitcoin có thể sử dụng sức mạnh băm của họ trên chuỗi nhỏ hơn mà không gặp rủi ro về phần thưởng khối Bitcoin của họ. Kết quả là, thợ mỏ sẽ có ít lý do hơn để hành động trung thực trên chuỗi nhỏ hơn.